Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trpm8Q8R4D5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trpm8Q8R4D5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms