Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hecw1Q8K4P8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms