Protein–RNA interactions for Protein: Q8K194

Snrnp27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, mousemouse

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Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp27Q8K194 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Snrnp27Q8K194 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Snrnp27Q8K194 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Snrnp27Q8K194 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Snrnp27Q8K194 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Snrnp27Q8K194 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Snrnp27Q8K194 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Snrnp27Q8K194 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Snrnp27Q8K194 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Snrnp27Q8K194 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Snrnp27Q8K194 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp27Q8K194 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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