Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SbsnQ8CIT9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SbsnQ8CIT9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.4 ms