Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Card11Q8CIS0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Card11Q8CIS0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Card11Q8CIS0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Card11Q8CIS0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Card11Q8CIS0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Card11Q8CIS0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Card11Q8CIS0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Card11Q8CIS0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms