Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CopaQ8CIE6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CopaQ8CIE6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CopaQ8CIE6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CopaQ8CIE6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CopaQ8CIE6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CopaQ8CIE6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CopaQ8CIE6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CopaQ8CIE6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CopaQ8CIE6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CopaQ8CIE6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CopaQ8CIE6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CopaQ8CIE6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CopaQ8CIE6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms