Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI1

Bola3, BolA-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bola3Q8CEI1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bola3Q8CEI1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bola3Q8CEI1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms