Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms