Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc9Q8CDN9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms