Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAS9

Parp9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp9Q8CAS9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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