Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C1R3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8C1R3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8C1R3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8C1R3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8C1R3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8C1R3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8C1R3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8C1R3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms