Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccser1Q8C0C4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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