Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Iffo1Q8BXL9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Iffo1Q8BXL9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Iffo1Q8BXL9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Iffo1Q8BXL9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Iffo1Q8BXL9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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