Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVW3

Trim14, Tripartite motif-containing protein 14, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim14Q8BVW3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim14Q8BVW3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms