Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pbrm1Q8BSQ9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pbrm1Q8BSQ9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms