Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gga3Q8BMI3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms