Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc38a9Q8BGD6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms