Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms