Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms