Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Zbed4Q80WQ9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Zbed4Q80WQ9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Zbed4Q80WQ9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Zbed4Q80WQ9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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