Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Avl9Q80U56 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms