Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms