Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf516Q7TSH3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf516Q7TSH3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf516Q7TSH3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf516Q7TSH3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf516Q7TSH3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf516Q7TSH3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf516Q7TSH3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf516Q7TSH3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf516Q7TSH3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf516Q7TSH3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf516Q7TSH3 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf516Q7TSH3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms