Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctdp1Q7TSG2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms