Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tnfsf18Q7TS55 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms