Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncapd3Q6ZQK0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms