Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ssxb3Q6XAS4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssxb3Q6XAS4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssxb3Q6XAS4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssxb3Q6XAS4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssxb3Q6XAS4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ssxb3Q6XAS4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ssxb3Q6XAS4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ssxb3Q6XAS4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ssxb3Q6XAS4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ssxb3Q6XAS4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssxb3Q6XAS4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssxb3Q6XAS4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssxb3Q6XAS4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssxb3Q6XAS4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssxb3Q6XAS4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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