Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc44a1Q6X893 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc44a1Q6X893 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc44a1Q6X893 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc44a1Q6X893 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc44a1Q6X893 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc44a1Q6X893 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc44a1Q6X893 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc44a1Q6X893 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc44a1Q6X893 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc44a1Q6X893 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc44a1Q6X893 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc44a1Q6X893 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc44a1Q6X893 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc44a1Q6X893 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc44a1Q6X893 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc44a1Q6X893 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc44a1Q6X893 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc44a1Q6X893 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc44a1Q6X893 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc44a1Q6X893 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc44a1Q6X893 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc44a1Q6X893 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc44a1Q6X893 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc44a1Q6X893 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc44a1Q6X893 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc44a1Q6X893 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms