Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms