Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gapvd1Q6PAR5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gapvd1Q6PAR5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gapvd1Q6PAR5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gapvd1Q6PAR5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gapvd1Q6PAR5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gapvd1Q6PAR5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gapvd1Q6PAR5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gapvd1Q6PAR5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gapvd1Q6PAR5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gapvd1Q6PAR5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gapvd1Q6PAR5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms