Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casc4Q6P2L7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casc4Q6P2L7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms