Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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