Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Asic1Q6NXK8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Asic1Q6NXK8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms