Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HelbQ6NVF4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms