Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sp140Q6NSQ5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms