Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Carmil1Q6EDY6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms