Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms