Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms