Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

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Length 675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms