Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrp4eQ66X19 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms