Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc8eQ66JT1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms