Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Abcg1Q64343 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Abcg1Q64343 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Abcg1Q64343 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Abcg1Q64343 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Abcg1Q64343 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Abcg1Q64343 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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