Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt12Q64291 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt12Q64291 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms