Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pan3Q640Q5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms