Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa13Q62424 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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