Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ss18Q62280 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ss18Q62280 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ss18Q62280 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ss18Q62280 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ss18Q62280 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ss18Q62280 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ss18Q62280 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ss18Q62280 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ss18Q62280 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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