Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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AtrxQ61687 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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AtrxQ61687 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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AtrxQ61687 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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AtrxQ61687 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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AtrxQ61687 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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AtrxQ61687 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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AtrxQ61687 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrxQ61687 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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