Protein–RNA interactions for Protein: Q61183

Papola, Poly(A) polymerase alpha, mousemouse

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Length 739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolaQ61183 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolaQ61183 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms