Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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