Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3Q60803 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms